لاکپشت های نینجا از یک گروه چهار لاکپشت جوان تشکیل شده اند که توانایی های خارق العاده ای دارند و توسط یک استاد آدم زنجیره ای بنام سنسی آموزش دیده اند. این لاکپشت ها علاوه بر مهارت های رزمی بالا، دارای توانایی های خاصی مانند شناخت شدید و استفاده از ابزار های پیشرفته هستند. زمانی که با تهدیدات مختلف از جمله شیطان بزرگ شر، آخرالزمان و دشمنان دیگر مواجه می شوند، این لاکپشت ها وارد ماجراجویی های جذاب و مهیجی می شوند که منجر به تغییرات دائمی و ارزشمند در شخصیت و مهارت های آنها می شود.