فصل دوم که «Alien Force» یا «اِلین فورس» نام دارد، در این فصل بن نوجوان 15 ساله ای است و کوین که از دشمنان بن در فصل اول بود، بن با کمک کوین و گوین به جنگ با افراد شرور می‌پردازد ولی در مقابل، پدر بزرگ بن گم می‌شود. در بخش اول این فصل دشمن اصلی بن هایبریت‌‌ها هستند. هایبریت‌‌ها که ادعای خالصی را دارند، مغز انسان‌‌ها را با تکنولوژی فضایی شست و شو می دهند و گونهٔ آن‌ها را تغییر می‌دهند؛ چون که هایبریت‌‌ها در حال انقراض هستند قصد دارند تا کل دنیا را از بین ببرند. در بخش دوم این فصل ویلگکس به همراه آلبیدو برمیگردد تا با بن تن جنگ کرده و زمین را تصاحب کند.و ویلگکس بعد از شکست چند دقیقه بن،آلبیدو را زندانی میکند و بن به همراه گوین و کوین و پدربزرگ مکس برمیگردد و ساعتی که در دست آلبیدو هست را برمیدارد و از یک طرف بن ولیگکس را شکست می دهد از طرفی دیگر بن صاحب ساعت جدیدی شده است و موجودات بن تن پیشرفته میشوند. نام ساعتی که بن صاحب آن می شود اسمش آلتیماتریکس است.