داستان پویانمایی بعد از شماره قبلی آن، «عدالت‌جویان: مرز جدید ، رخ می‌دهد. زمانی که جهان در صلح و آرامش به سر می‌برد تا اینکه آتلانتیس به خاطر مرگ پادشاهش به متروپلیس حمله میکند. اما ملکه نقشه دیگری در سر دارد و از عدالت جویان می‌خواهد پسر گمشده‌اش را پیدا کنند و…