درمان حساسیت به پروتئین گلوتن بر اساس از بین بردن مصرف محصولات حاوی گلوتن از رژیم غذایی، تغییرات اینترورینولوژیک، و مداخلات دارویی می‌تواند صورت گیرد. افراد مبتلا به حساسیت به گلوتن باید موادی که حاوی گلوتن هستند، از جمله گندم، جو و جیره رژیم آنها حذف شود. افرادی که حساسیت به گلوتن دارند نباید موادی که شامل گلوتن هستند، مصرف کنند.