فعالیت اصلی کارخانه قند اقلید استحصال شکر از چغندر قند می باشد که این فعالیت طی مراحل گوناگونی با روش آهک زنی صورت می‌گیرد.
دریافت چغندرقند از زمین های زراعی
سیلو و دپو کردن چغندر های وارد شده
شستشو و حذف گل و لای از سطح چغندرقند
انتقال چغندر قند به بخش آسیاب و خلال کردن
وارد شدن به دستگاه عصاره گیر یا دیفوزیون
جداسازی تفاله و انتقال به دستگاه پرس
حذف رسوب و ناخالصی‌های شکر
جذب ناخالصیها به ذرات آهک و رسوب آهک در شربت خام
گرم کردن شربت و عبور از صافی های مخصوص
رنگبری شدن شربت تولیدی
پخت شربت و حرارت دهی آن
کریستالیزاسیون و ارسال به سانتریفیوژ جهت استحصال شکر