نظام سلامت کشور دچار مشکلات متعددی است از کمبود پزشک در کشور گرفته تا نارضایتی مردم از خدمات درمانی، ورشکستگی بیمه های تامین اجتماعی و چاه پایان ناپذیر بودجه طرح تحول سلامت، این معضلات را آحاد جامعه می‌دانند.
اما شاید یکی از اصلی ترین معضلات نظام سلامت در کشور قرار گرفتن آموزش و درمان پزشکی در یک وزارت خانه است. این مشکل گره به مسائل دیگری همچون تعارض منافع ساختاری، کاهش ظرفیت پزشکی و... طناب پیچ شده و این‌ها را هم به‌وجود آورده است./5
دانشگاه های علوم پزشکی با بودجه بیش از 125 هزار میلیارد تومنی معاف از حسابرسی و نظارت توسط دیوان محاسبات هستند
خودمختاری دانشگاه های علوم پزشکی باعث شده به دلیل تعارض منافع، طرحهای کلان ملی مانند پرونده و نسخه الکترونیک سلامت به خوبی اجرایی نشوند.
در لایحه بودجه 1401 بیش از 187 هزار میلیارد تومن به نظام سلامت اختصاص یافته. حدود دو سوم این اعتبارات در اختیار دانشگاه‌های علوم پزشکی و بیمارستان‌های دولتی قرار می‌گیرد.
دانشگاه‌های علوم پزشکی از بزرگترین دستگاه‌های اجرایی کشور هستند که در احکام برنامه‌های توسعه کشور تاکنون از حسابرسی عمومی مستثنی بودند.
دستگاه های نظارتی هم روی آن ها هیچ گونه نظارتی نداشته‌اند. با مصوبه اخیر کمیسیون تلفیق گام بلندی در افزایش شفافیت و نظارت هزینه کرد بودجه به ویژه در دانشگاه‌های علوم پزشکی است.
براساس بند الحاقی 1 تبصره 19 لایحه بودجه 1401تمامی دستگاه‌های اجرایی مستثنی از قانون محاسبات عمومی از جمله دانشگاه‌های علوم پزشکی و ستاد مرکزی وزارت بهداشت مشمول حسابرسی قرار خواهند گرفت. این بند گامی مهم برای تحقق شفافیت و مبارزه با فساد و اتلاف منابع در بخش دولتی خواهد بود