نهادها از جمله دولت، سازمان‌های محیط‌زیست و اورژانس، دارای نقش بسیار مهمی در مدیریت سیلاب هستند. آن‌ها با ارائه خدمات پیشگیری، اطلاع‌رسانی، امداد و نجات، تعمیر و بازسازی برای کاهش خسارات و آسیب‌های ناشی از سیلاب، تاثیر بسزایی در مدیریت این پدیده دارند. همچنین هماهنگی و همکاری بین نهادها، اصلی‌ترین عامل موفقیت در مقابله با سیلاب است و باید توجه ویژه‌ای به این موضوع شود. از طرفی، نقص و کاهش در عملکرد نهادهای مرتبط می‌تواند منجر به افزایش خسارات و آسیب‌های ناشی از سیلاب شود. به عبارت دیگر، اهمیت نهادها در مدیریت سیلاب بسیار بزرگ است و باید به آن توجه کافی شود.