پس از اینکه لاک پشت ها در مخفیگاه جدید خود مستقر می شوند، منبع مشکل تله موش خود را کشف می کنند: بنیانگذار و مدیر عامل شرکت فناوری ، دکتر باکستر استاکمن. دوناتلو یک موش گیر را تعمیر می کند و لاک پشت ها ان را از طریق فاضلاب ردیابی می کنند، جایی که به طور تصادفی به اوریل اونیل، یک شاگرد جوان که از خشم دکتر استاکمن فرار می کند، برخورد می کنند.