برای نگهداری بهینه فلفل دلمه‌ای، ابتدا باید آن را در یک کیس یا کاور غذایی ضد نفخ قرار داده و در یخچال درجه حرارت ۴ درجه سانتیگراد قرار دهیم. برای حفظ تازگی و طعم بهتر، بهتر است فلفل را نسبتا سریع مصرف کنیم. اگر می‌خواهید فلفل را برای مدت طولانی‌تر نگه دارید، می‌توانید آن را بخورید و فریز کنید. از فلفل قبل از فریز کردن برداشتن هسته‌ها می‌تواند کمک کننده باشد.