برنامه‌های فوق تربیت محور مدرسه امام جواد، به برنامه‌ها و فعالیت‌هایی اشاره دارد که در این مدرسه با هدف ارتقاء اخلاق و ارزش‌های اسلامی در دانش‌آموزان اجرا می‌شود. این برنامه‌ها شامل مطالعه قرآن و احادیث، اجرای نماز جماعت، برگزاری جلسات مذهبی و اخلاقی، آموزش اصول اخلاقی و اجتماعی، و مشارکت در فعالیت‌های خیریه و اجتماعی می‌باشد. این برنامه‌ها به دانش‌آموزان کمک می‌کنند تا به شخصیتی اخلاقی، متعهد به ارزش‌های دینی و انسانی تبدیل شوند.