آیت‌الله خمینی (ره) به عنوان رهبر انقلاب اسلامی در ایران، با برخی انتقادها مواجه شده است که از جمله آن‌ها می‌توان به شیوه حکومت اسلامی و دستورات او اشاره کرد. انتقادها ممکن است به دلیل مواضع سیاسی، اجتماعی یا اقتصادی او باشد و برخی از افراد و گروه‌ها این انتقادها را از دیدگاه‌های مختلف مطرح کنند. اما انتقادات به آیت‌الله خمینی (ره) نشان از چندگانگی نظرات و اندیشه‌های مردم و جوامع مختلف در قبال وی دارد.