سیدحسن خمینی به شدت از عمل فیلترینگ در ایران انتقاد کرده است و با اعتقاد به آزادی بیان، این اقدامات را محدود کننده و غیر قابل قبول می‌داند. او اعتقاد دارد که این فعالیت‌ها مانع انتشار آزادانه اطلاعات و اندیشه‌ها، و به تبع آزادی فردی و حقوق بشر می‌شوند. او بر این باور است که دسترسی آزاد به اطلاعات و ایده‌ها باید برای همه افراد فراهم شود تا جامعه بتواند از طیف گسترده ای از نظرات و ایده‌ها بهره بگیرد و از تنوع فکری بهره‌مند شود.