روش پر کردن چاله چوله یک فرآیند ضروری است که برای حفاظت و حفظ زیستگاه‌های طبیعی به کار می‌رود. برای پرکردن چاله چوله، ابتدا باید از منابع آبی موجود در نزدیکی استفاده کرد. سپس با ایجاد یک سیستم آبیاری مناسب، از جمع آوری آب باران، آب مواد آلاینده و حفاظت از زمین در برابر فرسایش استفاده می‌شود. با این روش‌ها، چاله چوله پر شده و به محل اصلی خود برگشته و به بهبود کیفیت زمین و تنوع بوم‌شناسی کمک میکند.