مشکل ذرت‌های آلوده معمولا به عوامل مختلفی مانند آفت‌ها، بیماری‌ها، هواشناسی نامساعد و یا نقص در مراحل کاشت و داشت مربوط می‌شود. آفت‌های ذرت می‌توانند باعث ایجاد پوسیدگی، لکه سفید، لکه قهوه‌ای و یا نقطه‌های قهوه‌ای بر روی برگ‌ها و ساقه‌ها شوند. بیماری‌هایی مانند پوسیدگی ریشه، زونوز، خسارت آسکوکوک و یا راقبوم تاجی نیز می‌توانند از مشکلاتی باشند که ذرت‌های را تهدید میکند. برای مقابله با این مشکلات، استفاده از روش‌های آموزشی و پیشگیری از آفت‌ها و بیماری‌ها از اهمیت بسزایی برخوردار است.