تحصیلات خود را در رشته الکترومکانیک به پایان برد و برای ادامه تحصیل به آمریکا رفت و درجه دکتری در فیزیک پلاسما کسب کرد اما دست سرنوشت او را به مسیر دیگری برد چرا که پس از گذراندن آموزش‌های نظامی در مصر، به لبنان رفت و به همراه موسی صدر، در تشکیل جنبش امل نقش مؤثری داشت و از فرماندهان آن به شمار می رود.
شهید مصطفی چمران از جمله فرماندهان دوران دفاع مقدس بود که شروع جنگ، به اهواز رفت و ستاد جنگ‌های نامنظم را تشکیل داد.