پسری نوجوان به نام “ناتسومه تاکاشی”، از دوران کودکی‌اش می‌توانست “ارواح” را ببیند، اما مخفی نگهداشتن این توانایی، زندگی را برای او مشکل کرده است. ولی زمانی که “تاکاشی” کتابی به نام “Book of Friends” یا “کتاب دوستان” را از مادربزرگش “ناتسومه ریکو” به ارث می‌برد، همه چیز تغییر میکند. او درمی‌یابد که مادربزرگش، “ناتسومه ریکو”، قدرتی همانند او داشته و می‌فهمد چرا همیشه “ارواح” خوب و بد به سراغ او می‌آیند.بعد از پی بردن به معنای واقعی “کتاب دوستان” که به او اجازه می‌دهد ارواح لیست شده در صفحات آن را کنترل کند، “ناتسومه” سفری را به همراه محافظ خود، “مادارا”، روح بد‌نام، در پیش می‌گیرد تا ارواح را از قراردادشان با “ریکو” آزاد کند .