عليرغم اهميت صنعت داروسازي در كشور، وجود ابر چالش هايي توسعه اين صنعت را كند و با ابهاماتي مواجه كرده است.نحوه مواجهه سياستگذار با صنعت داروسازي از يك سوي طيف به عنوان «يك بخش كاملا وابسته به وزارت بهداشت به عنوان تأمين كنندگان داروي مورد نياز كشور» تا آنسوي طيف «به عنوان يك صنعت مستقل و نوآور» يكي از مهمترين اين چالشهاست.