قبل از انجام سونوگرافی NT، ناهنجاری‌های ساختاری جنین ممکن است نتوان به صورت روشن تشخیص داد. اما با انجام اولین سونوگرافی در هفته‌های اوایل بارداری، بعضی از ناهنجاری‌های ساختاری می‌توانند تشخیص داده شوند. این آزمایش می‌تواند به پزشک کمک کند تا اطمینان حاصل کند که جنین سالم است یا نیاز به مراقبت و مداخله دارد.