درمان نهایی کیست تخمدان ممکن است شامل جراحی برای از بین بردن کیست باشد، اما در برخی موارد ممکن است داروها نیز برای کنترل و کاهش اندازه کیست استفاده شود. درمان‌های دیگری مانند کرنیوساکروآپوپکسیمتومی (CSTA) و تخمی‌ایکوسیزالپینگوپرافراپ تا حد زیادی موثر هستند. مراجعه به پزشک تخصصی و مشاوره با او در مورد بهترین روش درمان برای حالت خاص شما ضروری است.