انیمیشن لگو ۲ داستان نسخه اول این سری را درست پنج سال بعد روایت میکند. شهروندان متوجه تهدید جدیدی برای شهر خود می شوند. مهاجمینی با نام Lego Duplo از فضا به شهر حمله کرده اند و همه چیز را که سر راهشان می بینند نابود می کنند. این تخریب چنان سریع است که دیگر مجال بازسازی را برای شهروندان نمی دهد. این مهاجمین با بمب گذاری سعی می کنند که فین و بیانکا جنگجویان شهر را از مهلکه دور کنند و کارهای خرابکاری خودشان را انجام دهند. این مصیبت همه شهروندان را با مشکل روبرو کرده است و به نوعی یک آخرالزمان لگویی را پدید آورده است. نبرد بین نیروهای شهر و ارتش Duplo همچنان برقرار است و باید دید که چه سرنوشتی در انتظار شهروندان خواهد بود