پروانه صدور شرکت‌های دانش‌بنیان از پروانه‌های صدور شرکت‌های معمولی تفاوت‌های مهمی دارد. به عنوان مثال، شرکت‌های دانش‌بنیان برای صدور پروانه نیاز به داشتن فناوری یا ابداع خاصی دارند و تاکید بیشتری بر نوآوری دارند. همچنین، این شرکت‌ها معمولا به اهداف تجاری با ارزش افزوده و بازده بالا متمایل‌اند و پروانه صدور آن‌ها به تایید ارزش و تاثیرگذاری فناوری وارد شده در کسب و کار بستگی دارد.